淮安市妇幼保健院新生儿科成立于1984年，是江苏省市级妇幼保健院中成立最早、规模最大、设备条件最好的新生儿专科之一，现为江苏省省级临床重点专科。1999年成为“淮安市新生儿重症监护中心”、淮安市首批临床重点专科，2012年成为江苏省妇幼健康重点学科，2016年成为第一批江苏省省级新生儿危急重症救治中心。

通过与多学科合作，近年来开展了从高危新生儿的产前诊断、产前干预、产时监护到产后救治、先天畸形的早期手术、常见遗传代谢病筛查及新生儿听力、早产儿视网膜病筛查等系统、全方位的新生儿救治体系，建立了专科实验室和成熟的院外转运系统。专科水平达到省内先进水平，建立新生儿安全产房、极/超低出生体重儿的综合管理及高危新生儿出院后随访体系。依托妇幼保健平台，实施从产前干预-转运-治疗-随访序列化运作模式。科室医疗用房约2700平方米，床位120张，配有国内一流专科治疗、转运设备。近三年来，年均转运危重新生儿350例，专科平均每年收治新生儿3000余人次，新生儿外科手术100余台次。

专科特色包括：超早产儿、极低及超低出生体重儿救治与管理；各种模式的呼吸支持；多项生理功能的无创和有创监测；外周动静脉同步换血术；全胃肠外静脉营养；早产儿视网膜病变筛查与治疗；床旁超声技术应用；遗传代谢病筛查；新生儿听力筛查；亚低温治疗；一氧化氮治疗；围手术期监护；神经监护单元；腹膜透析；PDA内外科治疗；高危新生儿出院后随访；母乳库；早产儿发展性照顾。